几十年来，制药 工程学院在各级领导的亲切关怀下，在全体同仁的不断努力下，走出了一条健康发展之路，办学规模不断扩大。原招收化学制药、生物制药、药物化学、环境科学、应用化学专业本科生，同时招收药物化学硕士研究生和博士研究生、微生物与生化药学专业硕士、博士研究生、生物化工及应用化学硕士研究生。1993年批准增设生物药学、制药工程学两个硕士学位授予权。1995年开始我校与吉林大学联合培养本-硕连读生物（技术）制药六年制学生。

 制药工程学院现设有化学制药系和生物制药系，八个教研室，两个实验中心。学院现有二个博士、硕士学位授予点和一个国家生命科学与技术人才培养基地（2002年教育部批准）。可招收制药工程、生物工程、生物技术、环境科学（2003年批准开始招生）专业本科生及生物技术本 -硕连读学生和药物化学、微生物与生化药学专业硕士、博士研究生，在校学生千余人。全院87名教职员工中，教授18人，副教授28人，正高工1人，高级工程师4人，讲师22人，工程师2人，助理级人员7人，专职干部9人。教师中研究生以上学历的占总数97%。学院现有博士生导师13人，硕士生导师42人。